原住民族教育在中小學和高教現場都面臨挑戰，立委蘇巧慧點出，國中小實施原住民族教育的「原住民重點學校」機制，是以原民學生人數或比率作為門檻欠缺彈性，導致門檻邊緣的中小學無法長期推行原住民族教育。
原民會教育文化處長 陳坤昇 VS 民進黨立法委員 蘇巧慧：「（我們其實過去很多委員，都有關注這個問題，就是原住民學校原住民師資的比例問題，問題在哪裡，問題就是地方政府在晉用原住民的師資上，一直沒有辦法去符合這個目標，接下來它99人，就不是重點學校了，所以它的師資就要重新調整。）對啊！然後它能夠補助的計畫也不一樣啊，怎麼會差一個人，差一個人那整個狀況就不一樣了，對原住民孩子教育的延續性，沒有一貫性。」
除了中小學，原住民學生在高教現場也是困境重重，立委徐欣瑩指出校園歧視的問題，以及原民大專生的休學率與退學率高於平均值，各大專院校的的原專班沒有統一的標準把關，充滿隱憂。
原民會教育文化處長 陳坤昇 VS 國民黨立法委員 徐欣瑩：「（原民專班我們原民會每年都有固定的補助，來協助他們開辦相關的。）好，你都補助，你現在就告訴我有錢，有錢我們應該要有年度原民專班的評鑑機制，那納入學生支持成效與後續追蹤的一個機制，你們要有這樣的一個數據，或者是要這樣去了解。」
完善的法規與評鑑機制，才能讓原住民學生兼顧文化與知識技能，原民會表示會多與其他部會協調合作，讓原住民族教育更健全。
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