由於安通野溪溫泉泡腳池位置約有一半位在河川行水區內，而且未申請相關許可，依法已被認定為不符規定設施，並存在防汛安全等疑慮 。同時近年來有部分民眾長期占用泡腳池，作為泡澡使用，並驅趕遊客來泡腳，引發爭議 。
玉里鎮長 龔文俊：「第一個因為這個池子，現在不但是違法地供電，第二個池子是違法的建築，第三個違反了《溫泉法》水量管制以及合法抽取的這些問題，而最重要的是長期使用的這些民眾，卻把人家民眾來，把人家趕，然後謾罵，產生了很多外地遊客，對於玉里鎮公所以及投訴到縣政府 。」
玉里鎮公所 4 月 1 日將對泡腳池實施斷電措施，並評估填平泡腳池或拆除相關設施的可行性 。對此，在地安通部落居民及不少民眾都表示相當可惜 。
安通社區發展協會理事長 張健治：「有很多部落的族人到那邊泡溫泉或泡腳，如果把它廢除覺得非常可惜，說真的非常可惜，深夜有些部落族人，會跑去泡溫泉，但是有人霸占，就非常不可取 。」
民眾 李女士：「這邊的居民，來這邊泡湯的，北中南的朋友，都覺得很可惜，這麼好的一個地方，而且對百姓身體健康方面也很好，環境這麼好，大家共同維護，要拆掉真的太可惜了 。」
安通露天野溪溫泉交通便利、泉質優良，是一處相當容易抵達的野溪溫泉 。溪畔設有三座泡腳池，提供遊客免費且近距離體驗溫泉，多年來吸引不少遊客前來造訪 。公所表示，泡腳池廢除後，未來也可能在野溪河床以堆砌石頭的方式規劃簡易泡腳區域，讓遊客仍能體驗野溪溫泉的自然樂趣 。
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