年底九合一選舉除了要選出地方首長及民意代表，也可能一併舉行多項公投。國民黨自6月開始，陸續提出反廢死、鞭刑入法及廢除非核家園三項公投案，主張交由全民決定。
國民黨立法委員 翁曉玲：「目前死刑仍然是合憲的條件之下，卻又在法律上強加合議庭的法官，要做一致決的這種嚴格限制，所以像這樣的憲判制，實質上已經架空了死刑的制度。」
國民黨立法委員 洪孟楷：「我們也要來問一下全民是說，是不是同意政府針對性侵害、虐童、詐欺等部分，除了現行罰則以外，再思考其他進一步的一個特別刑，包括鞭刑等等，如果說全民能夠同意的話，其實這就是一個重大政策的創制。」
國民黨團認為，死刑一致決門檻過高，希望透過公投降低判決門檻。另外針對性侵害、凌虐幼童及重大詐欺等犯罪，也希望透過鞭刑提高嚇阻效果。不過民進黨團以近期法院判決仍有死刑為例，認為並不存在實質廢死。
民進黨立法委員 陳培瑜：「2026年6月24號，康建生技的槍殺四人被告，更一審一致決判三個死刑，2026年7月9號，新北三重滅門案被告，一審國民法官判三個死刑，二審繼續維持三個死刑，所以如果按照您剛所說的，一致決會造成實質的廢死，那為什麼這些案件還可以判處死刑呢。」
至於鞭刑公投，民進黨團認為涉及憲法保障及國際人權公約等，因此主張相關配套仍須討論。
民進黨立法委員 陳培瑜：「還有這整套刑法體系，要不要跟著修正，因為它既然是新增刑法的部分，如果相關的修正沒有去進行評估，沒有進行討論，甚至沒有找過相關刑事或者是犯罪學專家來開會討論，我會認為其實非常地可惜，因為如果只有訴諸民意，這件事情會不會導致日後政策的窒礙難行。」
而在廢除非核家園公投方面，藍白兩黨主張核能不應被排除。不過，民進黨認為，現行法律已允許核電機組申請再運轉，因此質疑再次公投的必要性。由於朝野對三案都沒共識，後續將送交院會處理。依照規定，公投案最慢要在投票前90日公布，三案能否趕上11月28號九合一選舉，恐怕還有變數。
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