事故造成司機員手部骨折、8名旅客輕傷，除了司機員之外，其他人都已出院。卓榮泰除了對因事故造成驚嚇的民眾道歉，在6/22行政院也發布新聞稿表示，透過中央、地方合作，包含住宿補助、融資貸款、重建補助每坪最高12萬元等，加速推動0403花蓮震災復原重建方案，提供災民實質的照顧。
行政院長 卓榮泰：「因為我知道尤其0403之後，整個告警監測系統已經加強，但是是不是我們功能上的不足，區段上有疏漏，還是有什麼原因，怎麼還是造成這樣的事情，所以昨天(21)晚上我已經請李部長，責令台鐵要重新徹底而且有效地，檢測所有的告警監測系統，功能上有沒有疏忽掉，有沒有不足，該怎麼補救，或者是人為的注意上有沒有應該再更加強的地方，也向各位鄉親深深的鞠躬，我們一定檢討過去所帶來的不便，檢討過去所發生事情的經驗，唯有這樣子我們才能面對，以後每一天我們該做的事情，謝謝大家！抱歉！」
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